Department of Biosystems and Soft Matter

Employees and Teams

Head:		Department home page
Prof. Tomasz Lipniacki, PhD, DSc tel.no.: +48 22 826 12 81 ext. 409 room: 325 e-mail:

Secretary:

Agnieszka Ponarska
tel.no.: +48 22 826 98 03 / +48 22 826 12 81 ext. 228
room: 329
e-mail:

Department structure units:

Bio and Micro Fluidics Laboratory

Head: Sławomir Błoński, PhD

Employee	Position	Ext. phone	Room	E-mail
Sławomir Błoński, PhD	specjalista	413	312
Prof. Tomasz Kowalewski, PhD, DSc	profesor	422	227

Division of Complex Fluids

Head: Prof. Maria Ekiel-Jeżewska, PhD, DSc

Employee	Position	Ext. phone	Room
Balendra Vir Singh Chauhan, MSc	doktorant	446	327
Prof. Maria Ekiel-Jeżewska, PhD, DSc	profesor	227	323
Magdalena Gruziel-Słomka, PhD	specjalista badawczo-techniczny	446	327
Lujia Liu, PhD	adiunkt	421	322
Yevgen Melikhov, PhD	specjalista badawczo-techniczny	446	327
Honnenahalli Jagannatha Shashank, PhD	adiunkt	446	327
Agnieszka Słowicka, PhD	adiunkt	421	322
Paweł Sznajder, PhD	starszy specjalista	421	322
Stanisław Tokarzewski, PhD, DSc	emeryt	227	323
Chris Trombley, MSc	doktorant	446	327
Zbigniew Walenta, PhD, DSc	emeryt	446	327
Paweł Żuk, PhD	specjalista	421	322

Division of Modelling in Biology and Medicine

Head: Prof. Tomasz Lipniacki, PhD, DSc

Home page

Employee	Position	Ext. phone	Room
Rodrigo Azevedo Moreira da Silva, PhD	adiunkt	326	221
Sławomir Białecki, MSc	specjalista	423	328
Sławomir Błoński, PhD	specjalista	413	312
Maciej Czerkies, PhD	adiunkt	326	221
Beata Hat-Plewińska, PhD	specjalista badawczo-techniczny	411	326
Joanna Jaruszewicz-Błońska, PhD	adiunkt	411	326
Prof. Bogdan Kaźmierczak, PhD, DSc	profesor instytutu	450	310
Marek Kochańczyk, PhD	adiunkt	161	311
Paweł Kocieniewski, MSc	starszy programista	411	326
Michał Komorowski, PhD, DSc	profesor instytutu	449	324
Piotr Korczyk, PhD, DSc	profesor instytutu	413	312
Zbigniew Korwek, PhD	adiunkt	326	221
Prof. Tomasz Kowalewski, PhD, DSc	profesor	422	227
Paulina Koza, PhD	adiunkt	423	328
Barbara Kupikowska-Stobba, PhD	adiunkt	161	311
Tetuko Kurniawan, MSc	doktorant	225	225
Prof. Tomasz Lipniacki, PhD, DSc	profesor	409	325
Paweł Nakielski, PhD	adiunkt	448	321
Prof. Zbigniew Peradzyński, PhD, DSc	emeryt	450	310
Izabela Piechocka, PhD	adiunkt	448	321
Filippo Pierini, PhD, DSc	profesor instytutu	448	321
Adolfo Poma Bernaola, PhD	adiunkt	225	225
Wiktor Prus, PhD	adiunkt	225	225
Chiara Rinoldi, PhD	adiunkt	330	320
Jarosław Walczak, PhD	adiunkt	468	309
Karolina Zakrzewska, PhD	starszy specjalista	468	309
Damian Zaremba, MSc	asystent	161	311
Seyed Shahrooz Zargarian, PhD	adiunkt	330	320
Krzysztof Zembrzycki, MSc	asystent	330	320
Yasamin Ziai, MSc	doktorant	330	320

Department Employees

Professors	Ext. phone	Room
Prof. Maria Ekiel-Jeżewska, PhD, DSc	227	323
Prof. Tomasz Kowalewski, PhD, DSc	422	227
Prof. Tomasz Lipniacki, PhD, DSc	409	325
Associate Professors
Prof. Bogdan Kaźmierczak, PhD, DSc	450	310
Michał Komorowski, PhD, DSc	449	324
Piotr Korczyk, PhD, DSc	413	312
Filippo Pierini, PhD, DSc	448	321
Senior Researchers
Rodrigo Azevedo Moreira da Silva, PhD	326	221
Maciej Czerkies, PhD	326	221
Magdalena Gruziel-Słomka, PhD	446	327
Beata Hat-Plewińska, PhD	411	326
Joanna Jaruszewicz-Błońska, PhD	411	326
Marek Kochańczyk, PhD	161	311
Zbigniew Korwek, PhD	326	221
Paulina Koza, PhD	423	328
Barbara Kupikowska-Stobba, PhD	161	311
Lujia Liu, PhD	421	322
Yevgen Melikhov, PhD	446	327
Paweł Nakielski, PhD	448	321
Izabela Piechocka, PhD	448	321
Adolfo Poma Bernaola, PhD	225	225
Wiktor Prus, PhD	225	225
Chiara Rinoldi, PhD	330	320
Honnenahalli Jagannatha Shashank, PhD	446	327
Agnieszka Słowicka, PhD	421	322
Jarosław Walczak, PhD	468	309
Damian Zaremba, MSc	161	311
Seyed Shahrooz Zargarian, PhD	330	320
Krzysztof Zembrzycki, MSc	330	320
Ph.D. Students
Balendra Vir Singh Chauhan, MSc	446	327
Nikita Goltiakov, MSc	468	309
Frederic Grabowski, BSc	450	310
Ali Haghighat Bayan, MSc	448	321
Tetuko Kurniawan, MSc	225	225
Paweł Nałęcz-Jawecki, MSc	450	310
Felipe Nieves Marques Porto, MSc	423	328
Chris Trombley, MSc	446	327
Yasamin Ziai, MSc	330	320
Technical staff
Sławomir Białecki, MSc	423	328
Sławomir Błoński, PhD	413	312
Paweł Kocieniewski, MSc	411	326
Paweł Sznajder, PhD	421	322
Karolina Zakrzewska, PhD	468	309
Paweł Żuk, PhD	421	322
Retired
Prof. Zbigniew Peradzyński, PhD, DSc	450	310
Stanisław Tokarzewski, PhD, DSc	227	323
Zbigniew Walenta, PhD, DSc	446	327

Research

Current Ph.D. Projects:

No.	Subject	Supervisor	Ph.D. Student
1	Fale i oscylacje wapnia w komórce	Prof. Bogdan Kaźmierczak, PhD, DSc room 310, ext. phone 450	Sławomir Białecki, MSc specjalista room 328, ext. phone 423
2	Dynamics of microparticles in fluids	Prof. Maria Ekiel-Jeżewska, PhD, DSc room 323, ext. phone 227	Chris Trombley, MSc doktorant room 327, ext. phone 446
3	Modelowanie Kaskady MAPK oraz Integracja Szlaków NFkappaB/IRF/p53	Prof. Tomasz Lipniacki, PhD, DSc room 325, ext. phone 409	Paweł Kocieniewski, MSc starszy programista room 326, ext. phone 411

Proposed Ph.D. Projects:

No.	Subject	Supervisor
1	Modelowanie zjawisk związanych z wewnątrzkomórkową gospodarką wapniową	Prof. Bogdan Kaźmierczak, PhD, DSc room 310, ext. phone 450
2	Mathematical and numerical analysis of pattern formation during morphogenesis	Prof. Bogdan Kaźmierczak, PhD, DSc room 310, ext. phone 450
3	Analiza ścieżek regulatorowych aktywowanych w trakcie obrony immunologicznej komórek	Prof. Bogdan Kaźmierczak, PhD, DSc room 310, ext. phone 450
4	Microhydrodynamics of soft matter	Prof. Maria Ekiel-Jeżewska, PhD, DSc room 323, ext. phone 227
5	Dynamics of flexible microfibers in fluids	Prof. Maria Ekiel-Jeżewska, PhD, DSc room 323, ext. phone 227
6	Teoretyczna i eksperymentalna analiza odpowiedzi komórek na uszkodzenie DNA – model systemu regulatorowego p53	Prof. Tomasz Lipniacki, PhD, DSc room 325, ext. phone 409

Achievements

Habilitations

No.	Firstname	Lastname	Habilitation date	Work title	Discipline	Reviewers
1	Piotr	Korczyk	2017-02-23	Mechaniczne podstawy zastosowania kropel jako mikroreaktorów chemicznych w pasywnych układach mikroprzepływowych	Mechanika	prof. dr hab. Jacek Rokicki, Politechnika Warszawska, prof. dr hab. Witold Elsner, Politechnika Częstochowska, prof. dr hab. Zbigniew Adamczyk, IKFP PAN w Krakowie
2	Tomasz	Lipniacki	2007-06-15	Anizotropowa turbulencja w nadciekłym helu i dynamika wirów dyskretnych.	Mechanika	Dr hab. Konrad Bajer, Prof.Eryk Infeld, Prof. Ryszard Mańka, Prof. Andrzej Styczek
3	Janusz	Szczepański	2007-06-14	Zastosowanie układów dynamicznych w kryptografii.	Informatyka	Prof.Tadeusz Czachórski, Prof. Jerzy Gawinecki, Prof. Tomasz Kapitaniak, Prof. Ryszard Tadeusiewicz.
4	Stanisław	Tokarzewski	2007-03-15	Multipoint continued fraction approach to the bounds on the effective transport coefficients of the phase media.	Mechanika	Prof. Gwidon Szefer, Prof. Wiesław Pleśniak, Dr hab. Kazimierz Piechór, Dr hab. Mieczysław Cieszko
5	Maria Lidia	Ekiel-Jeżewska	2005-09-29	Oddziaływania hydrodynamiczne a współczynniki transportu zawiesin	Mechanika	Prof. Zbigniew Adamczyk, Prof. Marek Kuś, Dr hab. Kazimierz Piechór
6	Bogdan Andrzej	Kaźmierczak	2005-04-28	Fale biegnące w ośrodkach nieliniowych	Mechanika	Prof. dr hab. Zbigniew Peradzyński, Prof. dr hab. Roman Srzednicki, Dr hab. Dariusz Wrzosek

Ph.D. Theses

No.	Firstname	Lastname	Work title	Discipline	Supervisor	Reviewers	Year
1	Chatterjee	Paramita	Mathematical analysis of a new model of bone pattern formation	Inżynieria mechaniczna	dr hab. Bogdan Kaźmierczak	prof. dr hab. Ryszard Rudnicki, prof. dr hab. Dariusz Wrzosek	2020
2	Marek	Bukowicki	Dynamics of settling pairs of elastic particles at low Reynolds number regime	Inżynieria materiałowa	prof. dr hab. Maria Ekiel-Jeżewska	dr hab. Krzysztof Mizerski, IG, prof. dr hab. inż. Marek Morzyński, PP	2019
3	Marek	Kochańczyk	Kinetics of biochemical systems analyzed by numerical simulations	Informatyka	prof. dr hab. Tomasz Lipniacki	prof. dr hab. inż. Andrzej Świerniak, prof. dr. hab. Jacek Waniewski	2018
4	Marta	Gruca	Ruch regularnych układów wielu cząstek oddziałujących hydrodynamicznie w polu grawitacyjnym	Mechanika	prof. dr hab. Maria Ekiel-Jeżewska	dr hab. Krzysztof Mizerski, prof. IG PAN, dr hab. Jacek Pozorski, prof. IMP PAN	2016
5	Andrzej	Chmielowiec	Wydajne metody generowania bezpiecznych parametrów algorytmów klucza publicznego	Informatyka	dr hab. Janusz Szczepański, prof. IPPT	prof. dr hab. Jerzy A. Gawinecki (WAT), prof. dr hab. Zbigniew Kotulski (PW)	2012
6	Anna	Myłyk	Dynamika układów wielocząstkowych opadających grawitacyjnie w lepkim płynie	Mechanika	dr hab. Maria Ekiel-Jeżewska, prof. IPPT PAN	dr hab. Piotr Szymczak, Uniwersytet Warszawski, dr hab. Zbigniew Walenta, IPPT PAN	2012
7	Marcin	Kędzierski	Zastosowanie metody multipolowej do analizy oddziaływań hydrodynamicznych w cylindrycznym mikrokanale	Mechanika	dr hab. Eligiusz Wajnryb	dr hab. Anna Kucaba-Pietal, dr hab. Piotr Szymczak	2011
8	Beata	Hat-Plewińska	Wpływ ilości kopii genu na dynamikę sieci regulatorowych w komórce	Mechanika	dr hab. Tomasz Lipniacki	dr hab. Bogdan Kaźmierczak, dr hab. Jacek Miekisz	2010
9	Sławomir Paweł	Błoński	Analiza przepływu turbulentnego w mikrokanale	Mechanika	prof. Tomasz A. Kowalewski	prof. Piotr Doerffer, dr hab. Zbigniew Walenta	2009
10	Krzysztof	Dekajło	Analiza stabilności przepływów termicznych w pochyłej geometrii	Mechanika	prof. Tomasz A. Kowalewski	prof. Szymon Malinowski, dr hab. Zbigniew Walenta	2009
11	Piotr Michał	Korczyk	Drobnoskalowa turbulencja w procesie mieszania chmury z otoczeniem - model laboratoryjny	Mechanika	prof. Tomasz Kowalewski	prof. Stanisław Drobniak, dr hab. Zbigniew Walenta	2008
12	Agnieszka Małgorzata	Słowicka	Badanie metodą dynamiki molekularnej powstawania wybranych nanostruktur w emulsjach	Mechanika	dr hab. Zbigniew Walenta	dr hab. Anna Kucaba-Piętal, dr hab. Eligiusz Wajnryb	2008
13	Małgorzata	Zdanowicz	Analiza matematyczna równań modelujących plazmę w silniku jonowym	Mechanika	prof. Zbigniew Peradzyński	prof. Andrzej Palczewski, dr hab. Kazimierz Piechór	2007

Publications

Apparatus

No.	Name	Year of Production	Room	Contact
1	Laser dwuimpulsowy Nd:YAG (New Wave Research, SoloPIV) oraz synchronizator lasera impulsowego	2001	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
2	Kamera monochromatyczna typu "double-shuter" (PCO, SensiCam)	2003	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
3	Szybka kamera monochromatyczna (PCO, pco.1200 hs)	2004	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
4	Kamera monochromatyczna typu "double-shuter" (PCO, SensiCam)	2004	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
5	Mikroskop fluorescencyjny (Nikon, Eclipse E-50i)	2004	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
6	Laser impulsowy (EKSPLA, NL202)	2008	314	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
7	Serwer ACTINA, 128GB RAM, 24 CPU	2009	319
8	Zintegrowany mikroskop sił atomowych (AFM), mikroskop konfokalny i spektroskop Ramana (NT-MDT, NTEGRA Spectra)	2010	314	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
9	Mikroskop fluorescencyjny odwrócony (Leica, DMI3000B)	2011	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
10	Mikroskop konfokalny odwrócony z komorą przeżyciową (Leica, TCS SP5 X)	2012	319	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
11	Aparat Real-Time PCR (Applied Biosystems, QuantStudio 12K Flex)	2012	219	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
12	Autoklaw parowy 108L (HMC, HG113)	2012	220	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
13	Szybka kamera ze zintegrowanym wzmacniaczem obrazu (Lambert, HiCAM 500)	2012	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
14	Precyzyjna pompa strzykawkowa (Cetoni, neMESYS)	2012	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
15	Mikroprzepływowy system do hodowli i badania komórek (CellASIC, ONIX)	2012	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
16	Plasma Cleaner (Diener, ZEPTO PCCE)	2012	315	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
17	Laser impulsowy z powielaniem częstotliwości oraz układem kierowania emitowanej wiązki światła (EKSPLA, NL303D)	2012	316	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
18	Szczypce optyczne do badań biologicznych	2012	314	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
19	Mikroskop optyczny odwrócony z wyposażeniem do techniki TIRF (Leica AM TIRF MC)	2013	315	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413
20	Aparat digital PCR (Applied Biosystems QuantStudio 3D)	2015	219	Błoński Sławomir 22 826 12 81 ext. 413